A PJMP reconhece que a transformação acontece a partir da classe oprimida e prioriza a sua organização a partir desta classe. Nas dioceses onde todas as instâncias de coordenação são de PJMP, esta envolve tanto iniciantes quanto militantes. Não existe a Pastoral da Juventude Geral (PJG). Existem, porém, grupos de jovens da classe média isolados nas paróquias, que por vezes, estão organizados através de movimentos de juventude.
Em alguns lugares os jovens do meio rural são articulados pela Pastoral da Juventude do Meio Popular Rural (PJMPR). Em outros lugares existe uma Pastoral da Juventude Rural (PJR), que nasce a partir da PJG a, aos poucos, conquista a sua autonomia.
Nas dioceses onde a PJMP se organiza como pastoral de militantes, seus grupos são formados por elementos que atingem um certo nível de consciência na PJG.
Alguns militantes da PJMP trabalham na coordenação diocesana e regional da PJ com a finalidade de transformá-la numa pastoral que parta da ótica das classes populares.
